Al regresar de Europa fue nombrado en los siguientes cargos: Químico-Analítico, Director del Laboratorio Químico del Hospital Santo Tomás, Superintendente del mismo, Jefe de los Laboratorios de alimentos de Salud Pública y Profesor de Química de la Universidad de Panamá, desde la fundación de ésta. En diferentes ocasiones llevó el Profesor Zárate la representación de la Universidad y de nuestro país a congresos y seminarios internacionales. Sus ocupaciones de orden científico y didáctico no fueron obstáculo para que dedicara gran parte de su actividad intelectual y personal al estudio y difusión del Conocimiento de nuestro folclor y en general de las tradiciones nacionales que es donde está lo mejor y más grande de su obra. En este aspecto produjo artículos y ensayos numerosos que aparecen diseminados en diversos periódicos y revistas.
En colaboración con su esposa Dora P. de Zárate, publicó "La Décima y la Copla en Panamá", vasto estudio de nuestras formas poéticas populares, que ganó el concurso Ricardo Miró de 1952. Es también autor de "Brevario de Folklore", y de "Tambor y Socavón" con el cual también ganó el concurso Ricardo Miró de 1962.
Fue el organizador y creador del famoso Festival Nacional de la Mejorana en Guararé, que ha despertado la conciencia nacional hacia el aprecio y conservación de nuestras manifestaciones folclóricas más caras.
Fue objeto junto con su esposa, de numerosas distinciones de parte de entidades gubernamentales y de asociaciones folclóricas nacionales y extranjeras. Entre los galardones recibidos por él podemos destacar la orden Vasco Núñez de Balboa en el grado de Comendador, Pergamino del Municipio de Panamá, de la Asamblea Nacional, de la Sociedad Folklórica de Guatemala, de la Sociedad Salvadoreña y de la Sociedad Cultural de Veteranos.
Murió el Profesor Zárate en la ciudad capital de Panamá el 29 de octubre de 1968.